宇宙世纪0079 年，地球联邦和吉翁公国之间一年战争的末期，SIDE4的太空殖民卫星摩尔在吉翁军的攻击下破坏殆尽，大多数人在攻击中失去了生命。被破坏的殖民卫星、被击沉的战舰的无数残骸在暗礁宙域漂散着，不知不觉中残骸在不断地碰撞中开始产生放电现象，“雷霆宙域”的名字也因此而来。摩尔市民的幸存者构成的地球联邦军下属部队，摩尔同胞团怀着夺回故乡雷霆宙域的悲愿归来，渴望歼灭宙域中的吉翁军。联邦军的进军中滞留的吉翁军，为了收集义肢兵的战斗数据为目的而设立的活死人师团与之对峙。一心想要夺回故土的联邦军“摩尔同胞团”的“伊欧·弗莱明”少尉，与在之前的战斗中失去双脚的，现活死人师团的王牌狙击手“达里尔·洛伦兹”上士，各自怀着不同的目的与想法，开始了互相杀戮的宿命。