人类第一次经历的大规模宇宙空间战争，就是地球联邦政府和吉恩公国之间曾经爆发的那场战争。 在战争的最后一年，人型机动兵器 —— Mobile Suit（即 MS）进入了实用期。之后又过了 10 年..... 宇宙历 UC0087 年。居住在地球上的人和居住在殖民卫星中的人之间的纷争依然硝烟未息，人们的灵魂至今依然没有摆脱地球引力的束缚...... 居住在殖民卫星グリーンノア２的少年卡缪—比坦，因为同联邦军军人发生争执，一怒之下夺走了新型 MS — 高达 Ｍｋ—Ⅱ。并加入了反地球联邦组织『奥古』。在高达 Ｍｋ—Ⅱ 被夺走后，联邦军的精锐组织『提坦斯』使出了将卡缪的双亲强行劫为人质的卑劣手段。结果，卡缪亲眼目睹了双亲在自己眼前死亡。此时，在卡缪身边的是大尉古华多洛—巴吉纳，这位就是前吉恩公国军队中的王牌机师夏亚—阿兹纳布鲁。他一直坚信军队的存在是必须。带着失去双亲的痛苦又马上加入『奥古』的卡缪，在突破大气层向地球降下的过程中，又遇见了一个男人。此人就是夏亚昔日的夙敌，传说中的男子阿姆罗-雷......