不远的未来，一群变种的海洋生物与人类展开对抗，导致海平面上升，淹没了许多陆地。人类为了夺回赖以生存的土地，深入海洋寻找怪物巢穴，而“青之6号”就是人类寄予最后希望的一艘威力强大的潜水艇。