沙鲁奈公主乘机前往日本途中，飞机突然爆炸，唯公主一人得以生存并降落地球，可是其意识转为有预言能力的金星人，这金星人的使命就是要拯救将要灭亡的地球，金星的文化科学被宇宙怪兽王者基多拉破坏淨尽，奇古度拉的下一目标就是地球，可是地球怪兽哥斯拉跟拉顿却互相仇恨，并没有助人类的打算，摩斯拉唯有出动苦劝，望说服牠两对抗王者基多拉。