明的哥哥笃在两年前失踪。患有相当程度妄想症的明常被父母责备。有一天，明遇到一个神秘女子，她持有笃的驾照，并告知明，他的哥哥还活在她们村里的某个地方。但这个村子已经被怪物占领，希望明去解救这个村子。在犹豫之中，明和他的朋友为了营救哥哥踏上了盛开着彼岸花（即红花石蒜）的岛屿——彼岸岛，从而展开一个恐怖而离奇的冒险之旅